ニュース 1997 No.4

目次

1. 交換回線端局接続用電話番号の変更について
2. UNIXのグループ登録機能のテスト運用開始について
3. 簡易メーリングリスト機能の仕様変更について
4. データベースCSDの運用の変更について
5. データベースGEOMAGのデータ更新について
6. データベースMINJIのデータ更新について
7. SSLII/VPPライブラリへのメモリ節約型ルーチンの追加について
8. HPCメーリング・リストの開設について
9. GRAPHMANのレベルアップについて
10. UNIX用プリンタlinoの機種変更について
11. 「利用の手引き」の発行について
12. 分子軌道計算プログラムGaussian94特別プログラム講習会開催について
13. プログラム講習会開催案内
14. 広報（Vol.30,No.1）記事の訂正について
15. ケンブリッジ結晶学データベース（CSD）の利用条件「同意書」の提出について
16. 開発計画（1997年度前期）の追加募集について

1. 交換回線端局接続用電話番号の変更について

　交換回線の接続状況に合わせて，以下のような変更を平成9年4月15日に行いました。

1. システム資源の有効利用のため，MSPシステムのアナログ回線TTY手順を次のように統合し,モデムを高速化しました。従来から運用していた1200bps(753-7472),1200/2400bps(753-7474)TTY手順もこの番号で利用できます。
2. 過去利用されなかった種別を廃止し,新たな種別を設けました。

　この結果，変更した電話番号は以下の通りです。

詳細はセンター・ネットワーク掛 075-753-7432 へお問い合わせください。

2. UNIXのグループ登録機能のテスト運用開始について

　本センターの UNIXシステムの内、sakura および uxp において、グループ登録機能のテスト運用を開始します。なお、apps および abucus では運用いたしませんのでご注意ください。
　本センターの UNIX は１利用者が１グループを構成しています。従来は、他の利用者にファイルなどを公開するには、すべての利用者に対して公開しなければならず、セキュリティ上問題がありました。
　今回運用する、グループ登録機能は、ファイルやディレクトリを限定した利用者に公開するためのものです。なお、グループ登録およびグループ削除の完了には少々時間がかかります。

［グループ登録機能コマンド］
グループ登録
% addmygroup 登録する利用者番号

グループ削除
% delmygroup 削除する利用者番号

グループ構成員の表示
% mygroup

［利用上の注意］
　グループ登録機能はファイル・ディレクトリのアクセス権モードを利用しています。アクセス権には、利用者、グループ、その他の３者に対する許可モードを有しており、ls コマンドでその許可状況を見ることができます。また、chmod コマンドでアクセス権の設定が、デフォルトの許可モードを umask コマンドで設定します。
　本センターではこのデフォルトの許可モードが、利用者には読み取り権、書き込権、実行権、ディレクトリ内検索権が、グループには書き込権以外の許可モードを、その他には許可しないになっています (すなわち、umask 27 になっています)。

［例 １］
b98765 さんが a99999 さんと g99999 をグループ登録し、show.txt ファイルをグループに見せる。
% addmygroup a99999
% addmygroup g99999
% mygroup
b98765, g99999 and a99999 are in my group.
% chmod g+r show.txt
% ls -l show.txt
-rw-r----- 1 b98765 b98765 131495 Apr 8 11:54 show.txt

［例 ２］
a99999 さんをグループから削除する。
% delmygroup a99999

［例 ３］
b98765 さんが a99999 と g99999 をグループ登録し、mygroup ディレクトリ配下をグループに解放する。
% addmygroup a99999
% addmygroup g99999
% mkdir mygroup
% chmod g+rwx mygroup
% ls -ld mygroup
drwxrwx--- 2 b98765 b98765 512 Apr 8 11:55 mygroup

［例 ４］
ホームディレクトリ上のすべてのファイル、ディレクトリをグループ から読み書きされないようにする。
% cd
% chmod g-rwx *
% chmod g-rwx .[A-Z]* .[a-z]*

　具体的には［例 ３］のように、グループにアクセスを許すディレクトリをホームディレクトリに作り、その中だけを解放する方法が良いでしょう。なお、既に作られているファイルやディレクトリは、グループに対して書き込権以外の権利を許可していますので、［例 ４］のように chmod コマンドでグループに読み書きされないように許可を削除する必要があります。
　この後も、ホームディレクトリに新しくファイルやディレクトリを作ると、そのファイルなどはグループ構成員には公開していることになります。毎回、chmod コマンドでグループ許可の削除は手間ですので .cshrc ファイルに umask 77 を追加しておけば、利用者以外の許可は設定されません。

3. 簡易メーリングリスト機能の仕様変更について

　本センターでは、平成8年7月より汎用 UNIX システム (sakura) での簡易メーリングリスト機能のサービスを行っていますが(ニュース 1996 No.7参照)、その取り扱いを5月14日(水)より下記のように一部変更します(※が変更部分)。

簡易メーリングリスト機能では、UNIX システム共通のメールアドレスである

利用者番号@sakura.kudpc.kyoto-u.ac.jp

に加え、

利用者番号+メーリングリスト名@sakura.kudpc.kyoto-u.ac.jp

の形のアドレスでの着信を許します。後者の形のアドレスに対して届いたメールは、

~/.forward+メーリングリスト名

というファイルがあれば、そこに記述されたアドレスに転送されます。
メーリングリスト名には英小文字と数字、ハイフン(-）が使えます。

＊該当する転送アドレス設定ファイルがないアドレスに届いたメールは、エラーとなり発信者に返送されます。

　転送アドレス設定ファイル(~/.forward+メーリングリスト名)を持つメールアドレスに届いたメールの取り扱いはこれまで通りであり、利用者の方による設定変更の必要はありません。
　なお、従前通り、該当する転送アドレス設定ファイルがないアドレスに届いたメールを当該利用者に届いたものとして通常通り処理されることを希望される方は、consult@kudpc.kyoto-u.ac.jp までご相談ください。

4. データベースCSDの運用システムの変更について

　データベースCSDは主に有機金属化合物の結晶構造解析に関する文献情報および結晶構造データを蓄積したデータベースです。今回、CSDのバージョン・アップを行うとともに，運用システムをMSPシステムからappsシステムに変更いたします。これにともないデータベース環境の呼び出し方法の変更や機能追加があります。MSPシステムのCSDデータベースは今後バージョン・アップやデータの追加は行いませんのでご注意ください。
　なお，変更にともなう利用方法の解説を広報に掲載する予定です。

＜appsシステムでの運用開始日＞

1997年5月2日(金)

＜データベース環境の呼出し方法＞ ＜appsシステム＞

alba% csd
CSD>

(注: CSD> の促進文字に続けてCSDのプログラム(quest,pluto,gstat,vista,pdbget)が利用できます。また，unixコマンドも利用できます。)

＜データベースの終了方法＞

CSD> exit

<参考資料>

今回のバージョン・アップ版の解説資料は以下のWWWのURLの内容も参考にしてください。

http://www.kudpc.kyoto-u.ac.jp/Services/DataBase/csd/

5.データベースGEOMAGのデータ更新について

　データベースGEOMAGは地磁気観測に関する情報です。今回，テーブルSTATおよびテーブルSDTのデータを更新しました。
　SDTは観測データの保有情報であり，292件データの追加を行いました。更新は1997年3月18日に実施しました。ご利用ください。

＜データベースの呼出し方法＞ ＜MSPシステム＞

# RDB GEOMAG

＜検索例＞

STRACT> sel * from geomag.sdt where ye > 1996

6. データベースMINJIのデータ更新について

　データベースMINJIは最高裁判所の民事裁判の判決に関する情報です。昭和22年以降の民事判例からの情報が蓄積されています。今回，最近の判例情報の15件分が追加され， 合計件数は7,295件となりました。ご利用ください。
　データ更新は1997年4月1日に行いました。

＜データベースの呼出し方法＞ ＜MSPシステム＞

# DLS MINJI

7. SSLII/VPPライブラリへのメモリ節約型ルーチンの追加について

　４月１６日(水)より、SSLII/VPPにメモリ節約型のルーチンが追加されました。追加されたルーチンは、次の３つです。

・ＤＰ＿ＶＬＡＸ２：実行列の連立１次方程式（ブロック化されたＬＵ分解法）
・ＤＰ＿ＶＬＵＸ２：ＬＵ分解された実行列の連立１次方程式
・ＤＰ＿ＶＡＬＵ２：実行列のＬＵ分解（ブロック化されたＬＵ分解法）

　これらのルーチンは、同一の機能を持つＤＰ＿ＶＬＡＸなどに比べ使用するメモリーが約半分となっているため同じメモリー量で、約√2 倍の元数の連立１次方程式が解けます。ただし、性能はＤＰ＿ＶＬＡＸなどに比べ劣ります。リンクの仕方は従来通りです。
【例】
(abucusの場合)
frt -Wx -o オブジェクト名 プログラムファイル名 -lssl2vpp
(uxpの場合)
frtpx -Wx -o オブジェクト名 プログラムファイル名 -lssl2vpp
(MSPの場合)
@FORT,@FORT90コマンドで並列ジョブクラスを選択すると標準でSSLII/VPPのライブラリがリンク時に設定されるため指定の必要はありません。

各ルーチンの詳細については、Ｗｅｂで参照できます。URLは、

http://www.users.kudpc.kyoto-u.ac.jp/~w55015/Doc_List/user-only/ssl2vpp.txt

です。なお、参照時に利用者番号とパスワードの指定が必要です。

8. HPCメーリング・リストの開設について

　HPC(High Performance Computing)ユーザのための情報交換を目的に、HPCメーリング・リスト(以下、HPC-ML)を開設します。
　このHPC-ML開設の主旨は、本センターでサービスを行っているベクトル計算機および並列計算機の利用技術などに関連する話題で利用者間の情報交換の場を提供するとともに、センターからの技術情報の提供などにより支援を行っていきたいと考えています。

1) メーリングリストの目的
本センターのベクトル計算機および並列計算機に関する利用技術に関する利用者間での情報交換およびセンターからの技術情報の提供を行う。

2) 参加資格
原則として参加自由です。

3) 登録、脱退の手続き
・ 登録方法
メール・アドレスhpc-request@kudpc.kyoto-u.ac.jp 宛に 本文に「subscribe hpc-users」だけ記述してメールを送ってください。

・ 脱退方法
メール・アドレスhpc-request@kudpc.kyoto-u.ac.jp 宛に 本文に「unsubscribe hpc-users」だけ記述してメールを送ってください。

4) HPC-MLのメール・アドレス
hpc-users@kudpc.kyoto-u.ac.jp

9. GRAPHMANのレベルアップについて

　平成9年4月9日より、図形処理システムGRAPHMANがレベルアップされました。これに伴い、GRAPHMAN起動時に指定できる作業領域(Named Strage)が拡張され、最大 100MByte まで指定できるようになりました。作業領域100MB で利用する場合は、下のように LOGON 時にリージョンサイズ 100M を指定しておき、GRAPHMAN 起動時にNSオペランドを指定します。NSオペランドの単位は KByteで、オペランド省略値は従来通り 2000(KB) です。

LOGON TSS 利用者番号 S(100M)

# GRAPHMAN NS(100000)

　なお、今回のレベルアップに伴い、レベルアップ以前に作成されたBatch-Copyデータセットが扱えなくなりました。再度 GRAPHMAN の BCOPYコマンドでBatch-Copyデータセットを更新、あるいは作成してください。

10. UNIX用プリンタ lino の機種変更について

　長らくご利用いただいておりました UNIX 用プリンタ、Linotype-Hell社製Printer 60-J (プリンタ名 lino、解像度 600dpi) の寿命がつきましたので、機種の変更を行ないました。新しいプリンタは、日立工機社製 Typhoon 8で、解像度 1200dpi、内蔵フォント (漢字20書体、欧文126書体) も豊富になっています。プリンタ名は当分の間 lino で変更しません。
　なお、新しいプリンタも従来と同様に、清書出力用としての位置付けですので、プレーンテキストの印刷はできません。

[使用例]
PostScript ファイルの印刷
% lpr -Plino foo.ps

DVI(TeX) ファイルの印刷
% texpr -Plino bar.dvi

11. 「利用の手引き」の発行について

　下記の利用の手引きを発行しました。3階受付と図書資料室で配布していますのでご利用ください。

＊「利用の手引き―運用編（1997年度版）―」

12. 分子軌道計算プログラム Gaussian94 特別プログラム講習会開催について

　下記のとおり平成 9 年度特別プログラム講習会を開催いたします。

［講習の概要］
　この講習会は、計算機化学の代表的プログラム Gaussian94 の説明とその利用法の解説を初心者を対象に行なうものです。
最初に、Gaussian94 により原子・分子の世界のどのような量が計算できるかを説明します。次に、入力データの作成方法、特に分子構造に対応する Z- マトリックスの組み立て方を解説します。また、Gaussian90 での入力方法との相違点を示します。
　実習は、いくつかの簡単な分子を実際に計算し、得られた結果の見方、解釈の方法を説明します。すなわち、"#" マークに続くキーワードの意味と計算を通じて得られる結果、分子の安定構造や遷移状態の構造、電子密度、双極子能率、赤外線吸収波数などをあわせて説明します。また、実際に Gaussian94 を使用する上で参考になるいくつかのキーワードの組み合わせ方の例を紹介します。なお、振動モード表示のプログラム MOLCAT も展示されます。
　受講者の人数が多い場合、実習で十分な対応がとれない事態 (例えば、端末操作をグループでお願いする) もありますので、あらかじめご承知おきください。

13. プログラム講習会開催の案内

・456回 Macintoshによるセンター利用

・457回 WINDOWSパソコンによるセンター利用

・458回 UNIX入門

・459回 MSP入門

※講習テキストは当日配布いたします。

・460回 WWW、電子メール、ニュースの利用

・461回 パソコン通信クラリネットの利用

＊ 受講者定員 原則として30名
＊ 講習時間 10:30〜16:00 （特に講習時間を指定してある場合を除く）
＊ 会場 京都大学大型計算機センター３階講習室
＊ 申し込み Tel.075-753-7407,7424 または、センター３階受付カウンターにて

14. 広報 (Vol.30, No.1 1997) 解説記事の訂正について

　2月20日発行の広報 (Vol.30, No.1 1997) 解説記事、平野・岡部 「会話型ベクトル計算機VXの利用方法」の内容に、以下の4点の誤りがありました。お詫びいたしますとともに、次の通り訂正いたします。

p.8 右段 10行目
2. Fortran プログラムの並列化コンパイル (実行はVPP)

(誤) % frt -Wx paral1 paral1.f
(正) % frt -Wx -o paral1 paral1.f

p.8 右段 下から7行目
2. Fortran プログラムの並列化コンパイルと
SSL2並列版の組み込み (実行はVPP)

(誤) % frt -Wx paral1 paral1.f -lssl2vpp
(正) % frt -Wx -o paral1 paral1.f -lssl2vpp

p.10 左段 10行目

(誤) % (setenv LANG=ja; olias &)
(正) % (setenv LANG ja; xset +fp tcp/sakura:7100; olias &)

p.13 脚注 1

一部特殊な... (中略) ... 改善までしばらくお待ち下さい

を削除

以上4点です。

訂正版を Postscript ファイルにして
http://www.users.kudpc.kyoto-u.ac.jp/~w55070/HPC/VX-HowTo.ps
におきましたのでご利用ください。

15. ケンブリッジ結晶学データベース（ＣＳＤ）の利用条件「同意書」の提出について

　１９９４年度からケンブリッジ結晶学データベースシステム（ＣＳＤＳ）のアカデミックユーザーの利用取決めが厳格になっています。
　利用に当たっては、利用条件が記述された「同意書」（英文）の提出が新規の利用者のみ必要になっています。書類に必要事項を記入の上、日本の窓口となっている次の送付先へ直接書類を送付してくださるようお願いいたします。書類を一度提出され，引き続いて利用される場合は不要です。
　なお、同意書は本センター３階受付にて配布しています。　　　　　　　　　　　　　　　

16. 開発計画(1997年度前期)の追加募集について

　1997年度開発計画前期分を、下記のとおリ追加募集します。
開発計画は、比較的短期間に成果が多数の利用者に還元されるプログラム・ライブラリまたは、共用データベースの開発・作成を目的としています。したがって、その開発計画に汎用性のあることが必要となります。本計画のための利用負担金は、原則としてセンター負担となっています。
　詳細は、 http://www.kudpc.kyoto-u.ac.jp/Kaihatsu/ をご参照ください。

　　　　　　　　　　　　 記