Jupyter Lab

Jupyter Labを計算ノードで実行する場合は、以下のような方法で起動することができます。なお、プロセス並列の実行には対応していません。

ユーザ名(b59999)、キュー名(gr19999b)は適宜変更してください。

Miniforgeをロードします
```
$ module load miniforge3
```
初めてJypyterLabを利用する場合 は、以下のコマンドでインストールします。(実行は1度だけで良いです)
```
$ conda install jupyterlab
```
JupyterLabを計算ノードで起動します。（例：システムBでgr19999b キューを使う場合）

バッチ処理の場合
ジョブスクリプトを作成します。

$ vi run.sh
#!/bin/bash
#============ Slurm Options ===========
#SBATCH -p gr19999b
#SBATCH --rsc c=8               # 要求リソースの指定(8コアの例)
#SBATCH -t 3:00:00              
#SBATCH -o %x.%j.out            # ジョブの標準出力ファイルの指定
#============ Shell Script ============
set -x
srun jupyter lab --no-browser --ip=0.0.0.0

ジョブを投入します。

$ sbatch run.sh

会話型処理の場合
ジョブを投入します。

$ tssrun -p gr19999b --rsc c=8 jupyter lab --no-browser --ip=0.0.0.0

Jupyter Labが計算ノードで起動すると、以下のような接続情報が表示されます。

バッチ処理の場合

[b59999@laurel31 ~]$ tail <標準出力ファイル>
[C 2024-05-24 15:34:18.069 ServerApp]

To access the server, open this file in a browser:
    file:///home/b/b59999/.local/share/jupyter/runtime/jpserver-4144334-open.html
Or copy and paste one of these URLs:
    http://xb0037:8888/lab?token=f1031ba47cc702ccaac0433646ed4a848827a88b14521841
    http://127.0.0.1:8888/lab?token=f1031ba47cc702ccaac0433646ed4a848827a88b14521841

会話型処理の場合

[b59999@laurel31 ~]$ tssrun -p gr19999b jupyter lab --no-browser --ip=0.0.0.0
(省略)
[C 2024-05-22 17:08:38.648 ServerApp]

To access the server, open this file in a browser:
    file:///home/b/b59999/.local/share/jupyter/runtime/jpserver-4144334-open.html
Or copy and paste one of these URLs:
    http://xb0037:8888/lab?token=f1031ba47cc702ccaac0433646ed4a848827a88b14521841
    http://127.0.0.1:8888/lab?token=f1031ba47cc702ccaac0433646ed4a848827a88b14521841

ログインノード上でWebブラウザを起動します。
```
$ firefox
```
計算ノードでの起動方法の項番3で取得した接続情報のうち、下から2行目に記載の「http://xbXXXX:ポート番号/lab?token(以下略)」から始まる行の「xbXXXX」を「xbXXXX-ib0」に変更し、アドレス欄に入力して接続します。
（例）http://xb0037-ib0:8888/lab?token=f1031ba47cc702ccaac0433646ed4a848827a88b14521841

別ターミナルを起動し、ポートフォワーディングでシステムに接続します。（例：システムBにb59999で接続する場合）
```
$ ssh -L ポート番号:xbXXXX-ib0:ポート番号 b59999@laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp
```
計算ノードでの接続方法の項番3で取得した接続情報のうち、下から2行目に記載されている、「http://xbXXXX:ポート番号/lab?token(以下略)」の「xbXXXX」を「xbXXXX-ib0」に変更し、ポート番号は「xbXXXX」に続く4桁の数字を入力してください。
（例）$ ssh -L 8888:xb0037-ib0:8888 b59999@laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp
コマンドプロンプトやターミナルを閉じずに、Webブラウザでの表示へお進み下さい。

ポートフォワーディングの設定を参考に、ポートフォワーディングの設定をします。（例：システムBにb59999で接続する場合の手順4. の設定）
- <Forwarded port>：ポート番号
- <SSH server>：laurel.kudpc.kyoto-u.ac.jp
- <SSH login>：b59999
- <SSH port>：22
- <Remote server>：xbXXXX-ib0
- <Remote port>：ポート番号

計算ノードでの接続方法の項番3で取得した接続情報のうち、下から2行目に記載されている、「http://xbXXXX:ポート番号/lab?token(以下略)」の「xbXXXX」を「xbXXXX-ib0」に変更し、ポート番号は「xbXXXX」に続く4桁の数字を入力してください。
（例）<Forwarded port>：8888、<Remote server>：xb0037-ib0、<Remote port>：8888

手順7. まで終了したら、Webブラウザでの表示へお進み下さい。

お手元のコンピュータ上で、Webブラウザを立ち上げます。
Webブラウザのアドレス欄に、計算ノードでの接続方法の項番3で出力された接続情報のうち、一番下の行に記載されているURL(http://127.0.0.1:ポート番号/lab?token(以下略)) を最後までコピーし、貼り付けます。
以下のような画面が表示されたら接続成功です。

JupyterLabを起動したプロンプトでCtrl+C を2回押して、JupyterLabを終了します。

Jupyter Lab

計算ノードでの起動方法

起動したJupyterLabへの接続方法

FastXを用いる場合

コマンドプロンプトやターミナルなどを用いる場合

MobaXtermを用いる場合(Windowsのみ)

Webブラウザでの表示

終了方法